Khối cơ quan

• Phòng Kế hoạch - Tổng hợp
• Phòng Chính trị
• Phòng Hành chính - Quản trị
• Phòng Tài chính - Kế toán
• Phòng Vật tư trang bị y tế
• Phòng Điều dưỡng
• Phòng Đào tạo và chỉ đạo tuyến

Khối ngoại

• Khoa Ngoại chấn thương (B1)
• Khoa Ngoại sản (B2)
• Khoa Ngoại bụng (B3)
• Khoa Gây mê hồi sức (B4)
• Khoa Tai mũi họng (B5)
• Trung tâm Ung bướu (B6)
• Khoa Ngoại tiết niệu (B7)
• Khoa Răng hàm mặt (B8)
• Khoa Ngoại thần kinh (B9)
• Khoa Mắt (B10)

Khối nội

• Khoa Nội thần kinh (A1)
• Khoa Nội Tim mạch (A2)
• Khoa Nội Tiêu hóa (A3)
• Khoa Lao bệnh phổi (A4)
• Khoa Truyền nhiễm (A5)
• Khoa Y học cổ truyền (A6)
• Khoa Điều trị tích cực và chống độc (A7)
• Khoa Nội thận khớp (A8)
• Khoa Cấp cứu (A9)
• Khoa Nội tiết (A10)
• Khoa Điều trị cao cấp (A11)
• Khoa Da liễu (A12)

Khối Cận lâm sàng

• Khoa Khám bệnh (C1)
• Trung tâm Huyết học truyền máu (C2)
• Khoa Hóa sinh (C3)
• Khoa Vi sinh (C4)
• Khoa Giải phẫu bệnh (C5)
• Khoa Chẩn đoán hình ảnh (C6)
• Khoa Dược (C7)
• Khoa Kiểm soát nhiễm khuẩn (C8)
• Khoa Vật lý trị liệu (C9)
• Khoa Tiết chế dung dịch (C10)